制冷系統是凍干機的核心系統，穩定性決定著凍干制品的質量。制冷系統由閥門、管件構成，并由外部壓力繼電器、溫度傳感器、PLC進行開關控制和保護。
    要想使制冷系統穩定運行，需要做到：勤看壓力表、溫度表，是否在范圍內運行，勤聽設備運行有無雜音，勤查設備有無跑冒滴漏，及時做好保養工作，及時更換冷凍機油、過濾器，清洗水冷凝器內部水垢。
    冷卻水進入水冷凝器與制冷劑/冷凍油進行熱交換時，帶走熱量使被冷卻介質溫度下降到理想范圍。螺桿壓縮機電機采用水冷卻，并通過壓縮機冷卻水夾套帶走壓縮機工作時產生的熱量。
    壓力表在校驗期內；壓力表內機械油在接近滿度；讀取壓力表時，確認壓力表與系統連接閥門開啟；讀取壓力值需正視壓力表，因角度不同，可能引起讀數偏差。
    油位：在油視鏡上下刻度間；濁度：冷凍油清澈無雜質及懸浮物；油溫：在環境溫度以上（活塞機）。
    制冷系統所有的管道連接，部件安裝完成進行充氮氣打壓，采用氣泡檢漏法檢漏（檢漏液涂抹過的地方，需要及時使用清水清潔，避免檢漏液對部件表面產生腐蝕）。
    制冷系統的檢漏壓力須在1.4Mp—1.5Mpa。但壓縮機在開機過程中，高壓壓力可以達到1.5Mpa以上，才能確保系統不泄漏。
    保養期間，可以建立制冷系統的維護保養記錄，記錄保養時間、保養內容、故障排除等，方便后期管理和維護。
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